Scott Thunes (s. 1960, Los Angeles) on yhdysvaltalainen basisti, joka soitti Frank Zappan yhtyeessä 1981-1988 ja esiintyy albumeilla kuten Them or Us, Broadway the Hard Way ja Grammy-palkittu Jazz from Hell. Hänen soittotyylinsä yhdistää jazzimprovisoinnin, klassisen musiikin ajattelun ja punkin raakuuden - ja vuodesta 1984 hän toimi myös Zappan harjoitusjohtajana nimikkeellä Clonemeister. Pitkän tauon jälkeen hän palasi lavalle The Zappa Bandin kautta ja johtaa nykyään Thunes Institute of Musical Excellence (TIME) -ohjelmaa, joka kouluttaa nuoria muusikoita Bay Arealla.
Thunes johti Thunes Institute of Musical Excellence (TIME) -opiskelijabändiään eurooppalaisella kiertuella, joka tuki Gibby Haynesin (Butthole Surfers) esiintymisiä Helsingissä, Berliinissa, Amsterdamissa, Lontoossa ja muissa kaupungeissa.
Useat musiikkimediat ilmoittivat Gibby Haynes / TIME eurooppalaisesta kiertuella ja kuvasivat TIME:a ryhmäksi 13-19-vuotiaita nuoria muusikoita, jotka olivat harjoitelleet Thunesin johdolla kahden vuoden ajan.
Premier Guitar julkaisi haastattelun Thunesin kanssa hänen bassomuusikon urastaan Zappasta opettamiseen Marin School of the Artsissa.
The Zappa Band, jossa Thunes esiintyi Mike Keneallyn, Ray Whiten ja Robert Martinin kanssa, avasi King Crimsonin konsertteja useita kertoja heidän pohjoisamerikkalaisella kiertuella.
Thunes oli osa virallista Zappa-bändiä Frank Zappan hologrammi-kiertuella, jossa hän soitti bassoviulua ja lauloi taustalaululauluja.
